Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbc3Q99ML1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms