Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms