Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms