Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms