Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed9Q99KF1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms