Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms