Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CsprsQ99388 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms