Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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