Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss28Q924N9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms