Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms