Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim59Q922Y2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms