Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pde6cQ91ZQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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