Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna2Q91X60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms