Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms