Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sft2d2Q8VD57 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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