Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms