Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccm2lQ8VCC6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms