Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Ttc36Q8VBW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Ttc36Q8VBW8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ttc36Q8VBW8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms