Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmx1Q8VBT0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmx1Q8VBT0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms