Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Top1mtQ8R4U6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Top1mtQ8R4U6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Top1mtQ8R4U6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Top1mtQ8R4U6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Top1mtQ8R4U6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms