Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nsl1Q8K305 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms