Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms