Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms