Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms