Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms