Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb2Q8CC27 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb2Q8CC27 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb2Q8CC27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb2Q8CC27 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb2Q8CC27 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb2Q8CC27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms