Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrrn3Q8CBC6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrrn3Q8CBC6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrrn3Q8CBC6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrn3Q8CBC6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrn3Q8CBC6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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