Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nhsl1Q8CAF4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhsl1Q8CAF4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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