Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms