Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp38Q8BW70 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms