Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod1Q8BVA4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms