Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd4Q8BSD4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjd4Q8BSD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjd4Q8BSD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms