Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms