Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubash3bQ8BGG7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms