Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.2Q85ZW9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.2Q85ZW9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.2Q85ZW9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms