Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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