Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms