Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NanogQ80Z64 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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