Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms