Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ1

Ggn, Gametogenetin, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GgnQ80WJ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GgnQ80WJ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GgnQ80WJ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GgnQ80WJ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms