Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap1Q80TE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms