Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms