Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms