Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms