Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vma21Q78T54 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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