Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms