Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms