Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinlQ6ZQ12 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinlQ6ZQ12 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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