Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chsy1Q6ZQ11 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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