Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms